Welcome to Miyano Lab

What's New?!

  • 17/4/01 è½åˆå±•ã•ã‚“ãŒDNA情報解æžåˆ†é‡Žã®å­¦è¡“支æ´å°‚é–€è·å“¡ã«ç€ä»»ã—ã¾ã—ãŸã€‚
  • 17/3/01 山本茉å­ã•ã‚“ãŒDNA情報解æžåˆ†é‡Žã®å­¦è¡“支æ´å°‚é–€è·å“¡ã«ç€ä»»ã—ã¾ã—ãŸã€‚
  • 16/7/01 片山ç´çµµã•ã‚“ãŒã‚·ãƒ¼ã‚¯ã‚¨ãƒ³ã‚¹ãƒ‡ãƒ¼ã‚¿æƒ…報処ç†åˆ†é‡Žã®åŠ©æ•™ã«ç€ä»»ã—ã¾ã—ãŸã€‚
  • 16/4/16 加藤一郎ã•ã‚“ãŒç‰¹ä»»ç ”究員ã¨ã—ã¦ç€ä»»ã—ã¾ã—ãŸã€‚
  • 16/4/01 神内衣里香ã•ã‚“ãŒå­¦è¡“支æ´å°‚é–€è·å“¡ã€è§’田将典ã•ã‚“ãŒç‰¹ä»»ç ”究員ã¨ã—ã¦ç€ä»»ã—ã¾ã—ãŸã€‚
  • 15/11/16 油井å®æ˜­ã•ã‚“ãŒå­¦è¡“支æ´å°‚é–€è·å“¡ã¨ã—ã¦ç€ä»»ã—ã¾ã—ãŸã€‚
  • 15/9/14:学術支æ´å°‚é–€è·å“¡(常勤)ã‚‚ã—ãã¯å­¦è¡“支æ´è·å“¡(éžå¸¸å‹¤)を募集ã—ã¾ã™ã€‚詳ã—ã㯠求人情報をã”覧ãã ã•ã„。(終了ã—ã¾ã—ãŸï¼‰
  • 15/8/03:矢留雅亮ã•ã‚“ãŒå­¦è¡“支æ´å°‚é–€è·å“¡ã¨ã—ã¦ç€ä»»ã—ã¾ã—ãŸã€‚
  • 15/7/16:岡田愛ã•ã‚“ãŒå­¦è¡“支æ´å°‚é–€è·å“¡ã¨ã—ã¦ç€ä»»ã—ã¾ã—ãŸã€‚
  • 15/5/18:学術支æ´å°‚é–€è·å“¡ (常勤) を募集ã—ã¾ã™ã€‚詳ã—ã㯠求人情報をã”覧ãã ã•ã„。
  • 15/3/20:第29回 京都ãŒã‚“研究会ã«ã¦è¬›æ¼”ã„ãŸã—ã¾ã—ãŸã€‚演題「次世代シークエンスデータã«ã‚ˆã‚‹ä½“細胞変異ã®åŒå®šã¨ã‚¯ãƒªãƒ‹ã‚«ãƒ«ã‚·ãƒ¼ã‚¯ã‚¨ãƒ³ã‚¹ã®å®Ÿè£…ã€ï¼ˆäº•å…ƒæ¸…哉)http://bit.ly/1KGIU0i
  • 14/11/24:日本人類éºä¼å­¦ä¼šç¬¬59回大会(進展ã™ã‚‹ãŒã‚“ゲノミクス・エピゲノミクス研究)ã«ã¦è¬›æ¼”ã„ãŸã—ã¾ã—ãŸã€‚演題「臨床シークエンス情報インフラストラクãƒãƒ£ãƒ¼ã€ï¼ˆå®®é‡Žæ‚Ÿï¼‰
  • 14/11/09:サイエンスアゴラ2014「身近ã«ãªã£ãŸéºä¼å­æ¤œæŸ» ~ã¿ã‚“ãªã§ä»˜ãåˆã„方を考ãˆã‚‹~ã€ã«ã¦ã€ãƒ‘ãƒãƒ«ãƒ‡ã‚£ã‚¹ã‚«ãƒƒã‚·ãƒ§ãƒ³ã‚’è¡Œã„ã¾ã™ã€‚http://bit.ly/1zoYOKE
  • 14/11/05:読売新èžç¤¾ä¸»å‚¬ã€Œç”Ÿå‘½ã®è¨­è¨ˆå›³ éºä¼å­ã‚’å­¦ã¶ã€ã«ã¦ã€åŸºèª¿è¬›æ¼”ã€ãƒ‘ãƒãƒ«ãƒ‡ã‚£ã‚¹ã‚«ãƒƒã‚·ãƒ§ãƒ³ã‚’è¡Œã„ã¾ã™ã€‚http://bit.ly/1woSJJC
  • 14/10/01:森山å“也ã•ã‚“ãŒå­¦è¡“支æ´å°‚é–€è·å“¡ã¨ã—ã¦ç€ä»»ã—ã¾ã—ãŸã€‚
  • 14/09/26:日本癌学会学術ç·ä¼šã‚»ãƒƒã‚·ãƒ§ãƒ³ã€ŒãŒã‚“研究を推進ã™ã‚‹ãƒã‚¤ã‚ªã‚¤ãƒ³ãƒ•ã‚©ãƒžãƒ†ã‚£ã‚¯ã‚¹ã€ã«ãŠã„ã¦è¬›æ¼”ã—ã¾ã—ãŸã€‚
  • 14/09/21:ホテルã•ã£ã½ã‚文芸館ã«ãŠã„ã¦åŒ—æµ·é“æ–°èžä¸»å‚¬ 未æ¥ã‚’å¥åº·ã«ç”Ÿãã‚‹ãŸã‚ã®å¸‚民セミナー「生命ã®è¨­è¨ˆå›³ã€€éºä¼å­ã‚’å­¦ã¶ã€ã«ãŠã„ã¦ãƒ‘ãƒãƒ«ãƒ‡ã‚£ã‚¹ã‚«ãƒƒã‚·ãƒ§ãƒ³ã‚’è¡Œã„ã¾ã—ãŸã€‚http://bit.ly/1tUfWQg
  • 14/09/17:ゲノム創薬・医療フォーラム第1回シンãƒã‚¸ã‚¦ãƒ ã«ã¦è¬›æ¼”ã‚’è¡Œã„ã¾ã—ãŸã€‚http://bit.ly/1yoJhJv
  • 14/08/27, 28:æ±å¤§åŒ»ç§‘研医科学記念館ã«ã¦è¦ªå­ãƒ¯ãƒ¼ã‚¯ã‚·ãƒ§ãƒƒãƒ—ã‚’è¡Œã„ã¾ã—ãŸã€‚éºä¼ã«ã¤ã„ã¦ã®è¬›ç¾©ã€DNAã®æŠ½å‡ºå®Ÿé¨“ã€ã‚¹ãƒ‘コンã®è¦‹å­¦ã‚’è¡Œã„ã¾ã—ãŸã€‚http://bit.ly/1p38DUH
  • 14/07/09ï¼šæ–‡ç§‘çœ COI STREAM ã«ãŠã‘ã‚‹æ±å¤§åŒ»ç§‘研㨠DeNA ã®å…±åŒç ”究ã«ã¤ã„ã¦ã€ç¬¬äºŒå›žå ±å‘Šä¼šãŒè¡Œã‚ã‚Œã¾ã—ãŸã€‚http://bit.ly/ZzYyIo
  • 14/06/13:第3回スーパーコンピューター「京ã€ã¨ç”Ÿå‘½ç§‘å­¦ã«ãŠã„ã¦è¬›æ¼”ã‚’è¡Œã„ã¾ã—ãŸã€‚http://www.cyber.biotech.okayama-u.ac.jp/Ksympo/index.html
  • 14/06/03ï¼šæ–‡ç§‘çœ COI STREAM ã«ãŠã‘ã‚‹æ±å¤§åŒ»ç§‘研㨠DeNA ã®å…±åŒç ”究ã«ã¤ã„ã¦ã€ç¬¬ä¸€å›žå ±å‘Šä¼šãŒè¡Œã‚ã‚Œã¾ã—ãŸã€‚http://bit.ly/1viDJin
  • 14/04/01:林周斗ã•ã‚“ãŒä¿®å£«èª²ç¨‹ã«å…¥å­¦ã—ã¾ã—ãŸã€‚ãŠã‚ã§ã¨ã†ã€‚
  • 13/10/16:張耀中ã•ã‚“ãŒç‰¹ä»»ç ”究員ã¨ã—ã¦ç€ä»»ã—ã¾ã—ãŸã€‚
  • 13/10/03:林周斗ã•ã‚“(学部4年生)研究室ã®ä¸€å“¡ã«ãªã‚Šã¾ã—ãŸã€‚
  • 13/04/16:伊æ±è°ã•ã‚“ãŒç‰¹ä»»ç ”究員ã¨ã—ã¦ã€æ¸…水英悟ã•ã‚“ãŒå­¦è¡“支æ´å°‚é–€è·å“¡ã¨ã—ã¦ç€ä»»ã—ã¾ã—ãŸã€‚
  • 13/04/01:朴喜楥ã•ã‚“ãŒç‰¹ä»»ç ”究員ã¨ã—ã¦ç€ä»»ã—ã¾ã—ãŸã€‚

研究室ã®ãƒŸãƒƒã‚·ãƒ§ãƒ³

ã“ã®ç ”究室ã¯ï¼Œç”Ÿå‘½ã‚’システムã¨ã—ã¦ç†è§£ã—,ãれを創薬や治療ã¸ã¨ã¤ãªã’ã¦ã„ããŸã‚ã«å¿…è¦ãªã‚·ã‚¹ãƒ†ãƒ ãƒã‚¤ã‚ªãƒ­ã‚¸ãƒ¼ã®è¨ˆç®—戦略を構築ã™ã‚‹ã“ã¨ã‚’ミッションã¨ã—ã¦ã„ã¾ã™ï¼Žç”Ÿå‘½ç§‘å­¦ã¯è¶…多次元・超ヘテロãªå¤§è¦æ¨¡ãƒ‡ãƒ¼ã‚¿ã‚’出ã—ã¤ã¤ã‚ã‚Šã¾ã™ï¼Žãã®ãŸã‚ã®ãƒ‡ãƒ¼ã‚¿è§£æžæŠ€è¡“ã¨ç”Ÿä½“生命シミュレーション技術ã®èžåˆã‚’è¡Œã†ã“ã¨ã«ã‚ˆã‚Šï¼Œæƒ…å ±ã®æŠ½å‡ºï¼Œæ§‹é€ åŒ–,ãã—ã¦ã‚·ãƒŸãƒ¥ãƒ¬ãƒ¼ã‚·ãƒ§ãƒ³ã‚’è¡Œã„,医科学・生命科学ã®æ–°ã—ã„展開ã«å¯„与ã—ã¾ã™ï¼Žã‚¹ãƒ¼ãƒ‘ーコンピュータシステムã¯ãã®ãŸã‚ã«ä¸å¯æ¬ ã®ã‚¤ãƒ³ãƒ•ãƒ©ã§ï¼Œã“ã®ã‚·ã‚¹ãƒ†ãƒ ã‚’用ã„ã¦æ¬¡ã®ï¼“ã¤ã®ãƒ†ãƒ¼ãƒžã‚’柱ã«ç ”究を行ã£ã¦ã„ã¾ã™ï¼Ž

研究トピック

éºä¼å­ãƒãƒƒãƒˆãƒ¯ãƒ¼ã‚¯ç ”究ã¨è–¬å‰¤æ¨™çš„éºä¼å­ã®æŽ¢ç´¢

マイクロアレイを用ã„ã¦å¾—られるéºä¼å­ç™ºç¾ãƒ‡ãƒ¼ã‚¿ã¨æ§˜ã€…ã®ã‚²ãƒŽãƒ ãƒ¯ã‚¤ãƒ‰ãªéºä¼å­é–¢é€£æƒ…報(タンパク質相互作用,タンパク質細胞内局在情報ãªã©ï¼‰ä½¿ã£ã¦éºä¼å­ãƒãƒƒãƒˆãƒ¯ãƒ¼ã‚¯ã‚’推定ã™ã‚‹ãŸã‚ã®ç¨®ã€…ã®æ–¹å¼ï¼Œç‰¹ã«ï¼Œãƒ™ã‚¤ã‚¸ã‚¢ãƒ³ãƒ»ãƒãƒƒãƒˆãƒ¯ãƒ¼ã‚¯ã€çŠ¶æ…‹ç©ºé–“モデル,ブーリアン・ãƒãƒƒãƒˆãƒ¯ãƒ¼ã‚¯ãªã©ã‚’基ã«ã—ã¦ï¼Œæ•°åƒå€‹ã®éºä¼å­ã‹ã‚‰ãªã‚‹éºä¼å­ãƒãƒƒãƒˆãƒ¯ãƒ¼ã‚¯ã®ãƒ¢ãƒ‡ãƒ«åŒ–・推定・解æžã®ç ”究を行ã£ãŸï¼Žè¨ˆç®—ã«ã‚ˆã£ã¦æŽ¨å®šã•ã‚ŒãŸéºä¼å­ãƒãƒƒãƒˆãƒ¯ãƒ¼ã‚¯ã‚’用ã„ã¦è–¬å‰¤æ¨™çš„éºä¼å­ã®æŽ¢ç´¢ã‚„病気や薬剤応答ã«é–¢ã™ã‚‹éºä¼å­ãƒãƒƒãƒˆãƒ¯ãƒ¼ã‚¯ã®æŽ¢ç´¢ç ”究ã§æˆæžœã‚’å¾—ã¦ã„る.ãã®ä¸€ã¤ã«ï¼ŒHUVECを用ã„ã¦351ã®éºä¼å­ã‚’siRNAã§ãƒŽãƒƒã‚¯ãƒ€ã‚¦ãƒ³ã—ãŸãƒ‡ãƒ¼ã‚¿ã‹ã‚‰æŽ¨å®šã—ãŸãƒãƒƒãƒˆãƒ¯ãƒ¼ã‚¯ã§ï¼ŒTNF-αã§åˆºæ¿€ã—ãŸHUVECã«ãŠã„ã¦ç‚Žç—‡ã¨ã‚¢ãƒãƒˆãƒ¼ã‚·ã‚¹ã‚’制御ã—ã¦ã„ã‚‹ãƒãƒ–éºä¼å­ã‚’見ã¤ã‘ã¦ã„る.

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図1:351ã®éºä¼å­ã® siRNA ノックダウンã«ã‚ˆã‚‹DNAマイクロアレイ解æžãƒ‡ãƒ¼ã‚¿ã‹ã‚‰è¨ˆç®—ã•ã‚ŒãŸãƒ’ト血管内皮細胞éºä¼å­ãƒãƒƒãƒˆãƒ¯ãƒ¼ã‚¯ï¼ŽTNF-ï¡å‡¦ç†ã®ã‚‚ã¨ã§ï¼Œç‚Žç—‡ã¨ã‚¢ãƒãƒˆãƒ¼ã‚·ã‚¹ã‚’制御ã—ã¦ã„ã‚‹æ–°ãŸãªãƒãƒ–éºä¼å­ç¾¤ï¼Ž

生命システムã®ãƒ¢ãƒ‡ãƒ«åŒ–ã¨ã‚·ãƒŸãƒ¥ãƒ¬ãƒ¼ã‚·ãƒ§ãƒ³ã®ç ”究

éºä¼å­åˆ¶å¾¡æƒ…報やシグナルä¼é”ãªã©ã®ç”Ÿå‘½ã‚·ã‚¹ãƒ†ãƒ ã«é–¢ã™ã‚‹çŸ¥è­˜ã‚„データを電å­çš„ã«æ•´ç†ã™ã‚‹æŠ€è¡“åŠã³ï¼Œãã‚Œã«åŸºã¥ã„ã¦ã‚·ãƒŸãƒ¥ãƒ¬ãƒ¼ã‚·ãƒ§ãƒ³å¯èƒ½ãªãƒ¢ãƒ‡ãƒ«ã‚’構築ã™ã‚‹æŠ€è¡“を開発ã™ã‚‹ã“ã¨ã§éºä¼å­æ©Ÿèƒ½ã‚„生命システムã®è§£æžã‚’å¯èƒ½ã¨ã™ã‚‹æƒ…報技術を開発ã—ãŸï¼Žãã®æˆæžœã¯Cell Illustrator ã¨ã„ã†ãƒ‘スウェイã®ãƒ¢ãƒ‡ãƒªãƒ³ã‚°ã¨ã‚·ãƒŸãƒ¥ãƒ¬ãƒ¼ã‚·ãƒ§ãƒ³ã®ãŸã‚ã®ã‚½ãƒ•ãƒˆã‚¦ã‚§ã‚¢ã¨ã—ã¦å•†ç”¨åŒ–ã•ã‚Œã¦ã„る.ã¾ãŸåŒæ™‚ã«ï¼Œç”Ÿå‘½ã‚·ã‚¹ãƒ†ãƒ æƒ…報を記述ã™ã‚‹ãŸã‚ã®è¨€èªžã¨ã—ã¦CSML (Cell System Markup Language)(http://www.csml.org/)を開発ã—,ã“ã®Cell Illustratorã«ç”¨ã„ã¦ã„る.

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図2:Cell Illustrator上ã®ãƒ‘スウェイモデルã¨ï¼Œãã®ã‚·ãƒŸãƒ¥ãƒ¬ãƒ¼ã‚·ãƒ§ãƒ³ãƒ¢ã‚¸ãƒ¥ãƒ¼ãƒ«ã‚’用ã„ã¦åˆæœŸæ¡ä»¶ã‚’様々ã«å¤‰ãˆãŸã¨ãã®å‹•ãã‚’2次元åŠã³3次元プロットã—ãŸã‚‚ã®ï¼Ž

ペタスケール計算ã«ã‚ˆã‚‹ç”Ÿå‘½ç§‘学・医科学ã¸ã®å¿œç”¨æŠ€è¡“ã®ç ”究

1秒間ã«æ•°ãƒšã‚¿å›ž(1015)ã®è¨ˆç®—ã‚’è¡Œã†ã“ã¨ãŒã§ãる次世代スパコンãŒ2011å¹´ã¾ã§ã«ä¸–ç•Œã®æ§˜ã€…ã®ã¨ã“ã‚ã§ç¨¼å‹•ã—始ã‚る.ã“ã®æ¬¡ä¸–代スパコンã«ã‚ˆã‚Šï¼Œã“ã‚Œã¾ã§è¨ˆç®—能力ã®ç‚¹ã‹ã‚‰å…¥ã‚Šè¾¼ã‚€ã“ã¨ãŒã§ããªã‹ã£ãŸé ˜åŸŸã®ãŸã‚ã®æŠ€è¡“開発ã«å–り組んã§ã„る.ç¾åœ¨ï¼Œæ•°ä¸‡ãƒŽãƒ¼ãƒ‰è¦æ¨¡ã«å¯¾å¿œã§ãる次世代スパコンã«ã‚ˆã‚‹å¤§è¦æ¨¡éºä¼å­ãƒãƒƒãƒˆãƒ¯ãƒ¼ã‚¯æŽ¨å®šæŠ€è¡“開発を行ã£ã¦ã„る.ã“ã‚Œã«ã‚ˆã‚Šï¼Œãƒ’ト全éºä¼å­ã‚’対象ã¨ã—ãŸãƒãƒƒãƒˆãƒ¯ãƒ¼ã‚¯è§£æžã‚’目指ã—ã¦ã„る.ã¾ãŸï¼Œç”Ÿå‘½ã‚·ã‚¹ãƒ†ãƒ ã®ã‚·ãƒŸãƒ¥ãƒ¬ãƒ¼ã‚·ãƒ§ãƒ³ãƒ¢ãƒ‡ãƒ«ãŠã„ã¦ã‚‚計算能力ã®å£ãŒã‚り,ペタスケール計算ã®èƒ½åŠ›ã‚’用ã„ã‚‹ã“ã¨ã«ã‚ˆã‚Šï¼Œå€‹äººã®è¦³æ¸¬ãƒ‡ãƒ¼ã‚¿ã‚’パスウェイãªã©ã®ã‚·ãƒŸãƒ¥ãƒ¬ãƒ¼ã‚·ãƒ§ãƒ³ãƒ¢ãƒ‡ãƒ«ã«é©åˆ‡ã«èžåˆã™ã‚‹ã‚·ãƒŸãƒ¥ãƒ¬ãƒ¼ã‚·ãƒ§ãƒ³æŠ€è¡“を開発ã—ã¦ã„る.

図3.大è¦æ¨¡ãªç”Ÿä½“分å­ã®ãƒãƒƒãƒˆãƒ¯ãƒ¼ã‚¯ã‚’データã‹ã‚‰æŽ¨å®šã™ã‚‹æŠ€è¡“を開発ã—,ãれを「地図ã€ã¨ã—ã¦è–¬å‰¤ãƒ»ç–¾æ‚£ã®é–¢ä¸Žã™ã‚‹éºä¼å­ç¾¤ã‚’探索.次ã«ï¼Œé©åº¦ãªã‚µã‚¤ã‚ºã®ãƒãƒƒãƒˆãƒ¯ãƒ¼ã‚¯ã«ãƒ•ã‚©ãƒ¼ã‚«ã‚¹ã‚’絞り込ã¿ï¼Œã“ã®ã€Œä¸€èˆ¬ã€ã®ãƒ¢ãƒ‡ãƒ«ã«ã€Œå€‹ã€ã®ãƒ‡ãƒ¼ã‚¿ã‚’åˆç†çš„ã«ãƒ•ã‚£ãƒƒãƒˆã•ã›ã‚‹ç”Ÿå‘½ä½“データåŒåŒ–技術をé©ç”¨ã™ã‚‹ï¼Ž

Information

研究室å: æ±äº¬å¤§å­¦ 医科学研究所 ヒトゲノム解æžã‚»ãƒ³ã‚¿ãƒ¼
DNA情報解æžåˆ†é‡Ž
シークエンスデータ情報処ç†åˆ†é‡Ž
ä½æ‰€: 〒108-8639 æ±äº¬éƒ½æ¸¯åŒºç™½é‡‘å° 4-6-1
ç·åˆç ”究棟8F (DNA情報処ç†åˆ†é‡Ž)
ヒトゲノム解æžã‚»ãƒ³ã‚¿ãƒ¼4F (シークエンスデータ情報処ç†åˆ†é‡Ž)
電話番å·: +81-3-5449-5615
Fax番å·: +81-3-5449-5442
Email: miyanolab-jimu at edelweiss.hgc.jp

home.txt · 最終更新: 2017/04/05 15:12 by mlabadm