ホームページの更新方法

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新着情報の記載フォーマット

新たな成果やイベント情報を掲載します。

【フォーマットと例】

   *  08/11/15 : データ同化技術に関する論文が発表されました。これはソフトウェアASiMに実装されていま
す。[[http://bioinformatics.oxfordjournals.org/cgi/content/abstract/24/22/2592|Yoshida, R., et al. 
Bioinformatics. 24(22):2592-2601, 2008.]]
  • 日付:YY/MM/DD : 特定の日の場合。YY/MM/DD-DD : 期間の場合(月をまたぐとき:YY/MM/DD-MM/DD、年をまたぐとき:YY/MM/DD-YY/MM/DD)(例:08/11/15)
  • 内容:1~2行。開発ソフトウェアとの関連を記載します。(例:データ同化技術に関する論文が発表されました。これはソフトウェアASiMに実装されています。)
  • URL: [[リンク先|論文名など]](http://bioinformatics.oxfordjournals.org/cgi/content/abstract/24/22/2592|Yoshida, R., et al. Bioinformatics. 24(22):2592-2601, 2008.]])。
  • URLがない場合は、完全な論文情報を記載してください(例:Yoshida, R., Nagasaki, M., Yamaguchi, R., Imoto, S., Miyano, S., Higuchi, T. Bayesian learning of biological pathways on genomic data assimilation. Bioinformatics. 24(22):2592-2601, 2008.)
  • 日付の新しいものが上になるように記載します。
  • 新着情報が多くなった場合は、宮野が適宜編集し、「過去の情報一覧」へ移行します。

研究成果の記載フォーマット

論文などに発表した研究成果を記載します。

【フォーマットと例】

===== ペタスケールコンピューティングに向けた超多粒子フィルタの実装 =====
09/01/06

{{nakamura_psb09.pdf|Nakamura, K., Yoshida, R., Nagasaki, M., Miyano, S., Higuchi, T. Parameter estimation
of in silico biological pathways with particle filtering towards a petascale computing. Pacific Symposium
on Biocomputing. 14. In press.}} {{p-71nakamura.pdf|[BSCS2008ポスター発表]}}

データ同化手法の一種である粒子フィルタは並列性の高い手法である.その特性を生かし,超多数のサンプルを用いて
遺伝子ネットワークモデルのパラメータ推定を行った.その結果,従来の知見よりも遥かに多くのパラメータについて,
妥当な推定が可能であることを実験的に示した.同時に,アルゴリズムの検討と簡易的な時間見積もりを行い,ペタス
ケールコンピューティングにおいて,妥当な計算時間で結果が得られることを確認した.
これはソフトウェア[[software#開発コード:PF|PF]]に実装されます.

{{ 100millions_particles.png?600 }}
図:10万粒子(右)と1億粒子(左)のそれぞれの場合の初期状態推定の結果.1億粒子の方は適切に滑らかに変化し
ており,適切な分布の推定が得られているが,10万粒子では滑らかに変化せず,分布としての評価に問題があることが
わかる.
  • 日付:YY/MM/DD : (例:09/01/06)
  • 題目:1~2行。論文題目をそのまま記載するのではなく、日本語で簡潔に成果を表現する。
  • 論文名等:著者名・論文名・論文誌などの完全情報をリンク情報とともに記載する。
  • 内容:成果の概要を開発ソフトウェアとの関連をつけて記載する。成果に関する図などを付けてわかりやすくする。
  • 日付の新しいものが上になるように記載する。

開発ソフトウェアの記載フォーマット

開発ソフトウェアについて記載します。

  • 開発コード名:(例)SiGN
  • ソフトウェアの簡潔な記述:(例)ベイジアンネットワークによる大規模遺伝子ネットワーク推定
  • ソフトウェアの説明:どのようなプログラムが開発されているのかを説明します。

研究課題の詳細フォーマット

  • 研究の目的と意義(ぺたスケールの計算の必要性を含む)
  • 開発されるソフトウェアの機能
  • 何ができるようになるのか
  • 将来はどのように利用されるのか
  • 各年度の業務計画と実施内容(成果)
    • 平成20年度業務計画
    • 平成20年度実施内容(成果)(平成20年度の成果報告書に基づいて作成)
    • 平成19年度業務計画
    • 平成19年度実施内容(成果)(平成19年度の成果報告書に基づいて作成)
formats.txt · 最終更新: 2011/03/21 10:17 (外部編集)
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