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目次
第12回データ解析融合ワークショップ
| 日時 | 2010年12月24日（金）10:00-15:10 |
|---|---|
| 場所 | 東京大学医科学研究所総合研究棟８階大セミナー室 |
| アクセス | http://dnagarden.hgc.jp/ja/doku.php/access |
| キャンパスマップ | http://www.ims.u-tokyo.ac.jp/imsut/jp/access/campus/ |
| キャンパスマップにおける⑧の建物です．総合研究棟玄関の備え付けの電話で７５６１５にお電話ください．解錠いたします．その後，エレベータで８階までお越しください． | |
| 方式 | チームメンバー及び関係する研究者による発表形式 |
| 目的 | 研究の進捗状況とソフトウェアの開発状況について報告する． |
10:00-10:10
中間評価結果を受けた対応と平成23年度の予算見通しについて 宮野 悟
10:10-11:10
大規模遺伝子ネットワーク推定とその応用
- 宮野 悟：研究開発の進捗状況の報告及び今後２年間の研究計画
- 玉田嘉紀：大規模遺伝子ネットワーク推定ソフトウェアSiGNの開発状況と並列・オープンソースSSM推定ソフトウェアSiGN-SSMについて
- 山口 類：時系列遺伝子発現データからの薬剤効果推定手法の開発
- 長崎正朗：Systems Biologly integrative Pipeline (SBiP)の開発状況
- 日野原邦彦，後藤典子：乳癌細胞時系列データの取得状況について
11:10-12:10
大規模ゲノム多型と表現型データを関連付ける新規アルゴリズムの開発と，妥当性，有用性の検討
- 鎌谷直之：まとめと報告
- 三澤計治：ParaHaploをスパコンで走らせるための準備
- 藤本明洋，角田達彦：がん全ゲノムシークエンス解析パイプラインの構築状況
- 角田達彦：ExRATのMPI並列化
12:10-13:10
データ解析融合運営会議（鎌谷，秋山，樋口，宮野）
13:00-14:00
生命体シミュレーションのためのデータ同化技術の開発
- 樋口知之：平成22年度の研究進捗状況
- 中野慎也：A dynamic grouping strategy for massively parallel particle filter
- 斎藤正也：LiSDASの構成と外部ツールとの接続
- 長尾大通：マイクロアレイデータおよび転写因子相互作用データベースを基にした転写制御モジュール探索法の開発
- 吉田 亮：LiSDASの機能拡張・肺がん細胞株のゲフィティニブ応答解析・シミュレーション解析
14:00-15:00
大規模タンパク質ネットワーク推定とその応用
- 秋山 泰：網羅的PPI予測システムMEGADOCKの開発状況
- 松崎由理：Unbound構造データを用いたPPI予測精度の向上にむけたアンサンブルドッキングの試み
- 内古閑伸之：Bound構造とunbound構造を用いた相互作用プロファイルによるポストドッキング解析
15:00-15:10
総合討論
（連絡先）
miyanolab-jimu@edelweiss.hgc.jp （鈴木麻子，富安彩子） 電話：03-5449-5615
