第10回データ解析融合ワークショップ

プログラムの概要

宮野　悟　「次世代生命体統合シミュレーションソフトウェアの研究開発の状況についての報告」

大規模遺伝子ネットワーク推定とその応用

1. 宮野　悟　「本年度の成果の概要と平成22年度の業務計画」
2. 玉田嘉紀，島村徹平，山口　類　「大規模遺伝子ネットワーク解析ソフトウェアSiGN, L1GN, SSMの開発内容と進捗状況，及び今後の計画」
3. 長崎正朗　「データ解析融合プラットフォームの開発内容と進捗状況，及び今後の計画」
4. 島村徹平，井元清哉　「大規模遺伝子ネットワーク推定による上皮間葉移行に関わる分子メカニズムの探索」
5. 後藤典子　「データ取得状況」

昼食休憩 データ解析融合運営会議（鎌谷，秋山，樋口，宮野）

大規模ゲノム多型と表現型データを関連付ける新規アルゴリズムの開発と，妥当性，有用性の検討

1. 鎌谷直之　「大規模ゲノム多型データを用いた階層縦断的関連研究の意義と展望」
2. 三澤計治　「今年度開発したコンピュータプログラム」
3. 角田達彦　「次世代の疾患関連遺伝子探索研究」
4. 藤本明洋，角田達彦　「次世代シークエンサーによる多型および変異の大規模高速解析」

休憩

生命体シミュレーションのためのデータ同化技術の開発

1. 樋口知之　「H21年度の研究成果とH22年度に向けて」
2. 吉田　亮　「LiSDAS: Life Science Data Assimilation Systems」
3. 長尾大道　「Large-scale hybrid method of particle filter and MCMC for estimating parameters in biological pathway models」
4. 林　圭佐　「Parameter estimation of transcription network on GPGPU and its implementation」

タンパク質間相互作用ネットワークの推定とその応用に関する研究

1. 秋山　泰　「MEGADOCKの新機能と開発状況」
2. 大上雅史　「MEGADOCKにおける評価関数の改良とリランキングの導入」
3. 松崎由理　「MEGADOCKの網羅的タンパク質相互作用予測への応用（細菌走化性での評価、EGFRでの予備評価）」

miyanolab-jimu@edelweiss.ims.u-tokyo.ac.jp　（鈴木麻子，富安彩子）

03-5449-5615