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--- software [2018/05/07 20:34]
mlabadm [Cluster]
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mlabadm [Cluster]
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 ===== Cluster =====
-[[http://bonsai.hgc.jp/~mdehoon/software/cluster/index.html|{{cluster.gif|}}]]このソフトウェアは，マイクロアレイデータなどの遺伝子発現データのクラスタリングのための C 言語で書かれたライブラリです．このライブラリは，階層クラスタリング (correlation, ユークリッド距離， L1 距離などのさまざまな類似度，および，average, centroid, complete, single linage などのさまざまなクラスタ間の距離の定義を含む)，k-means，k-median クラスタリング，2次元自己組織化マップのコードを含んでいます．さらに，このライブラリのための Python と Perl のモジュールを用意しています．また，Single linkage を用いた階層型クラスタリングは， 10 万を超える個体を取り扱えるよう，メモリ効率の良いアルゴリズムを実装しています．このライブラリは， NCBI でも公的に用いられています．
+[[http://bonsai.hgc.jp/~mdehoon/software/cluster/index.htm|{{cluster.gif|}}]]このソフトウェアは，マイクロアレイデータなどの遺伝子発現データのクラスタリングのための C 言語で書かれたライブラリです．このライブラリは，階層クラスタリング (correlation, ユークリッド距離， L1 距離などのさまざまな類似度，および，average, centroid, complete, single linage などのさまざまなクラスタ間の距離の定義を含む)，k-means，k-median クラスタリング，2次元自己組織化マップのコードを含んでいます．さらに，このライブラリのための Python と Perl のモジュールを用意しています．また，Single linkage を用いた階層型クラスタリングは， 10 万を超える個体を取り扱えるよう，メモリ効率の良いアルゴリズムを実装しています．このライブラリは， NCBI でも公的に用いられています．

software.txt · 最終更新: 2018/05/07 20:34 by mlabadm

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